中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)重大科技任務(wù)團(tuán)隊招聘啟事

中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心于2016年3月正式組建成立。為了將生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)面向國家及社會的工程化服務(wù)與面向科學(xué)技術(shù)前沿的創(chuàng)新研究有機(jī)結(jié)合，中心依托上海生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)工程技術(shù)研究中心，組建了由研究員、工程師、博士后構(gòu)成的青年創(chuàng)新團(tuán)隊，投入面向生物醫(yī)學(xué)創(chuàng)新發(fā)展的生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)建設(shè)工作，積極推進(jìn)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)在人群隊列、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、表型組、微生物學(xué)等方面的數(shù)據(jù)體系、分析體系和應(yīng)用體系的建設(shè)。

研究所與團(tuán)隊簡介

中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所（以下簡稱“營養(yǎng)與健康所”）系根據(jù)中國科學(xué)院深化上海生命科學(xué)研究院改革決策部署，于2016年底整合組建的獨立事業(yè)法人研究機(jī)構(gòu)。營養(yǎng)與健康所面向人民生命健康，圍繞“健康中國”戰(zhàn)略、積極應(yīng)對人口老齡化國家戰(zhàn)略，聚焦“重大慢病防控與老齡健康促進(jìn)”科技戰(zhàn)略重點，打造國際知名的健康科學(xué)與技術(shù)機(jī)構(gòu)、科技智庫和健康產(chǎn)業(yè)促進(jìn)中心。

營養(yǎng)與健康所“十四五”期間生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)重大科技任務(wù)團(tuán)隊由張國慶研究員、王澤峰研究員、李海鵬研究員、高瑩研究員、黃濤青年研究員五個研究組聯(lián)合組建而成，張國慶任重大科技任務(wù)首席科學(xué)家，并邀請趙國屏院士、李亦學(xué)研究員等資深專家作為團(tuán)隊指導(dǎo)專家。團(tuán)隊擁有10PB級別的生命組學(xué)數(shù)據(jù)資源和文獻(xiàn)資源，30 PB存儲、250臺高性能服務(wù)器（其中TB級超大內(nèi)存服務(wù)器15臺）集群組成的計算資源一體化環(huán)境，通過https://www.biosino.org/ 提供對外服務(wù)。團(tuán)隊研究成果發(fā)表在Cell、Cell Research、Mol Cell、Cancer Cell、Nature Microbiology、Nature Methods、Nature Communications、Nucleic Acids Research、National Science Review、Briefings in Bioinformatics、Science Bulletin、American Journal of Clinical Nutrition等國際學(xué)術(shù)期刊。

研究內(nèi)容：生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)重大科技任務(wù)團(tuán)隊聚焦生命組學(xué)與健康醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)驅(qū)動的知識發(fā)現(xiàn)過程中的核心技術(shù)，圍繞核心數(shù)據(jù)資源匯聚、多模態(tài)數(shù)據(jù)管理、多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析、健康醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)治理、知識圖譜構(gòu)建等技術(shù)問題，開展系統(tǒng)生物學(xué)算法/軟件/流程研發(fā)、人群隊列/腫瘤等復(fù)雜慢性疾病知識發(fā)現(xiàn)研究，并推動在人口健康和臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用。

研究團(tuán)隊根據(jù)目前的發(fā)展需要，現(xiàn)面向國內(nèi)外招聘生物信息學(xué)研究方向的副研究員或助理研究員和博士后2名，數(shù)據(jù)科學(xué)研究方向的副研究員或助理研究員和博士后2名，誠摯邀請具有相關(guān)學(xué)科背景的優(yōu)秀青年學(xué)者加入。

一、研究方向

應(yīng)聘者任選一研究方向即可。

研究方向1：醫(yī)學(xué)信息的自然語言處理、數(shù)據(jù)治理和知識圖譜等關(guān)鍵技術(shù)的研究與應(yīng)用。

研究方向2：生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的自然語言處理、知識圖譜和海量數(shù)據(jù)可視化。

研究方向3：多組學(xué)數(shù)據(jù)分析及其在臨床及基礎(chǔ)研究中的應(yīng)用。

研究方向4：時空轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用。

二、應(yīng)聘要求：

1. 具有生物信息學(xué)、生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)治理、知識圖譜、人工智能、流行病學(xué)等相關(guān)科研經(jīng)驗；副研究員或助理研究員要求有至少2年博士后工作經(jīng)歷;博士后要求獲得博士學(xué)位時間不超過3年。

2. 應(yīng)聘博士后人員應(yīng)屆博士畢業(yè)生優(yōu)先；以第一作者（含并列）在領(lǐng)域核心學(xué)術(shù)期刊、會議發(fā)表過研究論文者優(yōu)先，或取得研究相關(guān)的專利的主要發(fā)明人優(yōu)先。

3. 本人有強(qiáng)烈科研意愿，希望能夠做出重要原創(chuàng)性技術(shù)突破。具備獨立開展科研工作能力，具有良好團(tuán)隊合作精神、良好的溝通交流能力及較強(qiáng)的中英文交流寫作能力。

三、福利待遇

1. 按照營養(yǎng)與健康所的規(guī)定，提供極具競爭力的薪酬待遇及良好的個人職業(yè)發(fā)展平臺，積極支持其崗位晉升和待遇提升。

2. 享受上海市相關(guān)社會保險、住房公積金等待遇，根據(jù)國家及上海市相關(guān)政策協(xié)助辦理人才落戶等。

3. 大力支持申報國家及上海市各類基金項目，以及中科院特別研究助理資助項目、青促會項目、中科院引才計劃等項目。

4. 支持參加高水平國內(nèi)外會議。博士后入站后將納入中科院特別研究助理崗位管理。

四、招聘方式及程序

1. 報名截止時間

長期有效，招滿為止。

2. 應(yīng)聘者須提供以下應(yīng)聘材料

（1）個人簡歷（教育經(jīng)歷、工作經(jīng)歷、發(fā)表論文、榮譽(yù)獎勵等）；

（2）有關(guān)證明材料：身份證、學(xué)歷及學(xué)位證書（學(xué)歷學(xué)位必須在學(xué)信網(wǎng)可查詢驗證）、相關(guān)資格證書、獲獎證書等；

（3）第一作者/共同第一作者的論文全文以及其他應(yīng)聘者認(rèn)為重要的書面材料。

五、聯(lián)系方式

有意向者，請將上述材料的電子版發(fā)至lujian@picb.ac.cn（請在應(yīng)聘材料和郵件主題欄注明應(yīng)聘崗位和姓名，按如下格式：“姓名－應(yīng)聘崗位”）。初審合格后，我們將盡快通知面試，擇優(yōu)錄用。謝絕來電來訪，應(yīng)聘材料恕不退還，本單位將予以保密。

團(tuán)隊科學(xué)家簡介

趙國屏院士，分子微生物學(xué)家，中國科學(xué)院院士，第三世界科學(xué)院院士，美國微生物科學(xué)院院士。多年從事微生物生理生化、代謝調(diào)控及酶作用機(jī)理的研究。參與組織中國人類基因組計劃，建立基因組學(xué)研究平臺；啟動生物芯片、生物信息學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)研究工作。在微生物基因組、代謝酶乙?；M、腸道微生物組研究方面，做出開創(chuàng)性工作。開拓系統(tǒng)合成生物學(xué)研究領(lǐng)域，在天然化合物人工細(xì)胞工廠合成、單染色體酵母構(gòu)建與CRISPR-Dx體系創(chuàng)建方面作出基礎(chǔ)性貢獻(xiàn)。

李亦學(xué)研究員，生物信息學(xué)專家。長期致力于生物信息學(xué)理論創(chuàng)新與應(yīng)用，取得開拓和系統(tǒng)性成果。在計算生物學(xué)理論方法與生命組學(xué)的融合方面，基于群體遺傳和進(jìn)化原理，建立錨定蘊(yùn)含關(guān)鍵遺傳信息的“Sweep”區(qū)域新計算模型，開展SARS、狼、狗、駱駝、蝎子和新冠病毒的比較和功能基因組研究，相關(guān)工作發(fā)表在Genome，Res. Mol. Biol. Evol.，Nature Comm.，Bioinformatics、Mol. Sys. Biol.，Nucle. Acids Res.，Oncogene等雜志，被Nature和Science雜志頭版報道評述，獲2020年中國十大生物信息學(xué)研究進(jìn)展。在計算生物學(xué)理論方法與基因編輯技術(shù)的融合方面，建立不依賴基因編輯技術(shù)體系和編輯位點特殊性深度學(xué)習(xí)算法，相關(guān)工作發(fā)表在Science，Nature，Nature Method，Cell Stem Cell， Nature Rev Gastro&Hepat，Nature Sci. Rev.等雜志，獲2019年“中國生命科學(xué)十大進(jìn)展”。詳細(xì)情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/kzyjy/201803/t20180327_4986743.html。

張國慶研究員，從事生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)管理體系與知識圖譜研究，中國遺傳學(xué)會生物大數(shù)據(jù)專業(yè)委員會委員，中國醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會生物醫(yī)學(xué)信息技術(shù)分會委員。相關(guān)研究得到國家重點研發(fā)計劃、基金委國家重大科研儀器研制項目（部門推薦）、中國科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項（B 類）、上海市市級科技重大專項等國家和上海市的重大重點項目資助。詳細(xì)情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtbssds/202203/t20220311_6388137.html ；近期研究論文詳見 https://orcid.org/0000-0001-8827-7546 。

王澤峰研究員，中科院計算生物學(xué)重點實驗室主任。長期從事RNA系統(tǒng)生物學(xué)研究及相關(guān)技術(shù)研發(fā)，包括RNA可變剪接的調(diào)控；環(huán)形RNA的非典型翻譯及其生理功能；設(shè)計人工RNA結(jié)合蛋白質(zhì)來操控RNA。2014年在國際上首次發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNA可進(jìn)行翻譯來合成蛋白，并系統(tǒng)性鑒定了非典型RNA翻譯調(diào)控元件，開創(chuàng)了環(huán)形RNA作為新一代mRNA療法的應(yīng)用。于Cell，Mol Cell, Cancer Cell, Nat Struct Mol Biol, Cell Research, Nat Methods, Nature Communications, PNAS, eLife等核心雜志發(fā)表論文70余篇并被廣泛引用。獲多項國際國內(nèi)獎勵。受邀任科學(xué)通報，JMCB，BBA advance副主編和多個學(xué)術(shù)期刊編委。詳細(xì)情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtyjzz/201803/t20180327_4986754.html。

李海鵬研究員，長期致力于發(fā)展進(jìn)化理論，解決關(guān)鍵生物學(xué)問題，發(fā)表SCI論文60余篇。為中國營養(yǎng)學(xué)會營養(yǎng)與組學(xué)技術(shù)分會副主任委員、上海市生物物理學(xué)會理事、中國遺傳學(xué)會終身會員及多個期刊編委。主要學(xué)術(shù)貢獻(xiàn)為：創(chuàng)建采用全基因組數(shù)據(jù)估計群體進(jìn)化歷史后再檢測正選擇的校準(zhǔn)型經(jīng)典方法體系；揭示祖先群體可能比衍生群體更加遠(yuǎn)離外群，糾正教科書中一個重要錯誤；創(chuàng)建從非平衡溯祖樹檢測正選擇的理論體系，提高檢測精確度；將人工智能引入群體遺傳學(xué)，成功檢測正選擇，并建立迄今為止最為精確的人類遺傳重組圖譜；創(chuàng)建用聯(lián)合突變頻譜估計多群體進(jìn)化歷史的新方法；圍繞中科院先導(dǎo)任務(wù)組隊進(jìn)行攻關(guān)，開發(fā)綜合分析免費(fèi)軟件eGPS，助力大數(shù)據(jù)深度挖掘；發(fā)展正選擇檢測新方法，精準(zhǔn)定位非編碼區(qū)的社會增強(qiáng)子PAS1，揭示PAS1-Lhx2對羊膜動物社會階層形成的關(guān)鍵作用，并且突變PAS1可反轉(zhuǎn)社會階層，揭示社會階層如何通過演化出現(xiàn)；創(chuàng)立快速極小時間溯祖新理論，首次獲得任意群體模型下突變頻率頻譜的解析解，發(fā)現(xiàn)90萬年前舊石器時代人類曾面臨滅絕的威脅，解釋非洲人類化石的重要缺失環(huán)節(jié)。詳細(xì)情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtyjzz/201803/t20180327_4986742.html。

高瑩研究員，研究方向為營養(yǎng)分子流行病學(xué)，目前主要研究脂肪酸攝入和代謝在代謝紊亂、癌癥和生長發(fā)育中的作用；尋找可以和營養(yǎng)因素共同影響疾病危險性的表觀遺傳因素以第一作者和通訊作者身份在Gastroenterology, International Journal of Cancer, American Journal of Clinical Nutrition, Journal of Nutrition, British Journal of Nutrition 等期刊發(fā)表SCI論文30余篇；擔(dān)任Journal of Nutritional Biochemistry 編輯。詳細(xì)情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtyjzz/201803/t20180328_4987324.html 。

黃濤青年研究員，研究方向為生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)和網(wǎng)絡(luò)分析。曾在美國紐約西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院從事博士后研究。目前擔(dān)任中國科學(xué)院青年創(chuàng)新促進(jìn)會生命分會副會長。發(fā)表論文100余篇，累計引用超過1萬次，連續(xù)多年入選Elsevier中國高被引學(xué)者和全球前2%頂尖科學(xué)家榜單。主持或參與國家自然科學(xué)基金委項目、國家重點研發(fā)計劃、中國科學(xué)院先導(dǎo)科技專項、上海市自然科學(xué)基金項目、國際人類表型組計劃等國家及省部級研究項目10余項。詳細(xì)情況介紹請參考http://www.sinh.cas.cn/rcdw/qtbssds/202203/t20220310_6387862.html ；近期研究論文詳見 https://scholar.google.com.hk/citations?hl=en&user=N6meTgoAAAAJ 。